Морской порт был основан в октябре 1896 года на восточном берегу Каспийского моря. В целях консолидации и упорядочения перевозок грузов и пассажиров 1 января 1903 года было образовано Управление морского торгового порта. Учитывая увеличение грузопотока с годами, в 1959 году на территории порта было начато строительство паромной переправы. В 2000-2003 годах была проведена масштабная реконструкция порта. Были реконструированы старые и построены новые причалы для судов, а также склады и ряд других объектов с приобретением современного оборудования. Это позволило оказывать портовые услуги на более высоком уровне.

     Учитывая удобное геоэкономическое положение Туркменистана, в соответствии со «Стратегией развития Туркменбашинского Международного морского порта и торгового флота Туркменистана до 2020 года», на основании Постановления Президента Туркменистана, подписанного 29 мая, 2014 года было начато строительство Туркменбашинского Международного морского порта, предусмотренного в качестве одного из основных участков Великого шелкового пути, а 2 мая 2018 года при участии Президента Туркменистана состоялось торжественное открытие нового Туркменбашинского Международного морского порта.